MGI平台转座酶法建库;全基因组测序;宏基因组测序
· 建库耗时短:单个样品建库时间约90分钟
· 兼容性广:兼容不同物种基因组建库
· 下机数据质量优:下机数据覆盖度高、均一性好
TruePrep DNA Library Prep Kit for MGI 是针对MGI高通量测序平台定向开发的专用试剂盒。使用该试剂盒可以将DNA样品制备成MGI高通量测序平台专用的测序文库。和传统文库构建方法相比, TruePrep试剂盒采用新型的转座酶法进行DNA片段化,将繁琐的DNA片段化、 末端修复和接头连接等步骤变为一步简单的酶促反应,显著降低了起始模板的投入量并缩短了文库构建时间。该试剂盒共有三种规格,分别适用于起始模板DNA投入量为50 ng 、 5 ng和1 ng的反应,使用者可根据实验类型自由选择。
1. 稳定的文库产出
使用Vazyme #TD501-TD503与Vazyme #TDM501-TDM503分别对50 ng、5 ng、1 ng的293细胞gDNA进行建库。不同投入量分别建库后,文库产量稳定。
2. 物种兼容性
以293细胞、拟南芥、水稻、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、嗜盐古菌、λDNA为模板, 使用Vazyme #TD501-TD503与Vazyme #TDM501-TDM503分别进行建库,文库产出稳定。
3. 优异的测序数据质量
对不同物种的全基因组文库进行测序,Vazyme #TDM501-TDM503下机数据在Mapping Rate、Dup Rate、Coverage等方面表现良好。
TDM501,所有组分-30 ~ -15℃保存;
TDM502,5 × TS 15 ~ 25℃保存,其余组分-30 ~ -15℃保存;
TDM503,5 × TS 15 ~ 25℃保存,其余组分-30 ~ -15℃保存。
1. 该试剂盒是否包含打断步骤?
答:包含。TruePrep试剂盒采用新型的转座酶法进行DNA片段化,将繁琐的DNA片段化、末端修复和接头连接反应等步骤变为一步简单的酶促反应,显著缩短了实验耗时。
2. TruePrep系列试剂盒利用转座酶打断DNA是否存在偏好性?
答:转座酶打断时存在一定的偏好性,但测试表明其并不影响测序结果及数据分析。
3. 可否采用TDM502或TDM503构建50 ng起始的DNA文库?
答:不推荐这么做,TDM501、TDM502、TDM503分别对应的模板投入量为50 ng、5 ng 和1 ng,相应试剂盒中酶的浓度不同。如采用TDM502或TDM503构建50 ng起始的DNA文库,将使模板DNA片段化不完全或者大小偏大,导致最终的文库与预期相差较远。因此强烈建议根据实际DNA起始量选择相应规格的产品。
4. 使用TDM501/502/503构建DNA文库时,55°C反应10 min后可否不用磁珠纯化或TS溶液终止反应,而直接进行PCR文库扩增?
答:请按照说明书流程进行纯化或终止反应,否则片段化反应不能有效终止,可能导致最终的文库总长度与预期相比偏小、文库质量较差等。
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